Гуманитарные программы ФГУ "Фонд взаимопонимания и примирения" осуществлялись за счет средств австрийского Фонда "Примирение, мир и сотрудничество", германского Фонда "Память, ответственность и будущее", муниципалитетов немецких городов и инициативных групп Германии.
 
Австрийский Фонд примирения предоставил часть оставшихся от выплат денежных средств для оказания бывшим узникам социально- медицинской помощи. В ходе осуществления этой гуманитарной программы российский Фонд обеспечил: реабилитационными приборами - 4690 человек; фармацевтической продукцией - 4997 человек; санаторно-курортном лечением -1434; комплексным медицинским обследованием, стоматологическими услугами и т.д.- 394 человека. Программа завершена в декабре 2005 г.
 
Германский Фонд "Память, ответственность и будущее" также предоставил оставшиеся от выплат денежные средства для оказания бывшим узникам социально- медицинской помощи.
 
В рамках программы "лечение и операции по улучшению зрения" оперативное лечение глаукомы, катаракты, а также консервативное лечение органов зрения в специализированных клиниках получили 170 бывших узников, проживающих в разных регионах Российской Федерации. Программа завершена в августе 2008г.
 
За период с октября 2006 по август 2008 г. санаторно-курортное лечение в профильных санаториях, расположенных во всех регионах Российской Федерации, а также на территориях Литовской и Латвийской Республик, получили почти 8 тыс. человек. Программа практически завершена.

 
Участие в прочих программах германского Фонда "Память, ответственность и будущее":

 
Гражданские инициативные группы Германии, в качестве жеста примирения между народами и в целях сохранения памяти о жертвах национал-социалистского произвола приглашавшие российских граждан - бывших узников - обращались в российский Фонд за информационной и организационной поддержкой. Российский Фонд являлся организатором поездок бывших узников в Берлин, Люнебург, Эрфурт, Гессен и Гассау, Битингхайм-Биссинген и Франкфурт-на-Майне; на апрель 2009 г. запланирована поездка группы бывших узников по приглашению Сената Гамбурга.
 
Российский Фонд обеспечил участие в юбилейных мероприятиях, посвященных 60-ой годовщине освобождения лагеря Аушвиц (Освенцим), делегации россиян - бывших узников этого лагеря.
 
При организационной поддержке российского Фонда города Франкфурт-на-Майне и Фрайбург, берлинская организация "Контакты-Контакты", благотворительный Фонд им. Максимилиана Кольбе осуществляли собственные денежные выплаты российским гражданам.
 
В рамках выполнения пункта 3.16 Перечня основных мероприятий по подготовке и проведению празднования 60-й годовщины Победы в Великой Отечественной войне 1941 - 1945 гг., утвержденного Президентом Российской Федерации 28 августа 2003 г. № Пр-1610, российский Фонд совместно с Федеральным архивным агентством осуществил работу по созданию выставки "Невольники Третьего Рейха".
 
Международная выставка открылась 11 апреля 2005 г, в течение полутора лет экспонировалась в Государственном центральном музее современной истории, Центральном музее Вооружённых сил, Центральном музее Великой Отечественной войны 1941-1945 гг. на Поклонной горе. Далее выставка была передана Центральному музею Великой Отечественной войны для создания на ее базе постоянно действующей экспозиции.
 
В рамках программы поддержки "Международное гуманитарное сотрудничество" в июне 2007 г. Попечительский Совет германского Фонда разработал программу "Место встречи - Диалог", направленную на социализацию пожилых людей - бывших узников. Предполагается, что в 2008 году программа будет реализовываться в Белоруссии, России и Украине.